文|《中國科學報》記者王兆昱 見習記者 江慶齡

“一蓑煙雨任平生。”在讀到蘇軾的僅年詞時，生物遺傳學家丹尼爾·法魯什（Daniel Falush）找到了知音，感慨這句詩詞亦是中國他人生的真實寫照。

21年前，研新丹尼爾關于幽門螺桿菌基因組學的聞科研究登上Science。多年來，如此高效他一直深耕此領域。現(xiàn)到學網(wǎng)

“中國的發(fā)表胃癌發(fā)病率較高，能否從細菌基因組學的僅年角度找到原因？”2019年，丹尼爾從倫敦起飛，感慨跨越重洋來到上海，中國成為中國科學院上海免疫與感染研究所的研新研究員。4年間，他組建起一支充滿活力的國際化團隊。

丹尼爾常感嘆，在中國做研究“很高效”。10月16日，Nature在線發(fā)表了丹尼爾團隊的最新成果。他們發(fā)現(xiàn)了一種與常見類型不同的幽門螺桿菌“生態(tài)種”，它常伴隨更嚴重的胃病。

這一研究，從發(fā)現(xiàn)到發(fā)表，僅用兩年時間。

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丹尼爾（左一）與他的團隊。

發(fā)現(xiàn)獨特“生態(tài)種”

對大多數(shù)病原體來說，人類胃部是個“禁區(qū)”，強酸會將它們一一消滅。然而，幽門螺桿菌不僅能在胃酸中生存，還能潛入胃黏膜并迅速繁殖，甚至使胃部的細胞“叛變”，引發(fā)持續(xù)性炎癥，最終成為胃癌的隱秘推手。

更可怕的是，幽門螺桿菌的感染往往在童年時發(fā)生。由于兒童的免疫系統(tǒng)不成熟，細菌更容易“扎根”，導致終生感染。

“自人類誕生以來，幽門螺桿菌就與我們同在，我們想找出其歷史的更多細節(jié)。”丹尼爾告訴《中國科學報》。

帶著這樣的“執(zhí)念”，丹尼爾團隊聯(lián)合瑞典、日本的科學家，著力收集世界各地的幽門螺桿菌樣本，甚至前往人跡罕至的偏遠地區(qū)采樣。從寒冷荒蕪的西伯利亞，到“與世隔絕”的美國原住民社區(qū)，都留下了他們的足跡。

“功夫不負有心人”，他們匯集了一個相當廣泛的全球樣本，共包含近7000個幽門螺桿菌基因組。

在此基礎上，研究人員發(fā)現(xiàn)了一組非常有趣的菌株。此菌株與常見類型不同，存在于北美、西伯利亞、智利的一些土著群體中。他們將其命名為“hardy”，寓意為“耐寒的”。

“這是一種不尋常的‘生態(tài)種’。”丹尼爾解釋道，“生態(tài)種指同一物種內(nèi)，因適應不同生態(tài)環(huán)境，而在基因上表現(xiàn)出微小差異的種群。”

Nature官網(wǎng)論文截圖。

研究人員推測，幽門螺桿菌在人類早期、走出非洲之前就分裂為兩種“生態(tài)種”，并隨著人類的遷徙在全球傳播。

隨著進一步研究，丹尼爾團隊還在老虎、獵豹等大型貓科動物（食肉動物）的胃部發(fā)現(xiàn)了hardy菌株的“身影”。

他們大膽提出假設：hardy菌株可能與愛吃肉的飲食習慣相關。證據(jù)是hardy菌株發(fā)展出了基因的“第二版本”，編碼了額外的依賴鐵的尿素酶，以幫助它們適應食肉動物更酸的胃。但該假設尚未經(jīng)過驗證。

此外，帶有hardy菌株的人通常患有嚴重的胃病，胃癌發(fā)病率很高。“但尚未證實hardy類型有更強的攻擊性。我們希望在不遠的將來找到答案，并助力設計更好的治療方法。”丹尼爾說。

中國科研：“很高效”！

丹尼爾坦言，早先也有學者注意到hardy菌株的存在，但丹尼爾團隊不僅發(fā)現(xiàn)了這一“生態(tài)種”，還詳細闡明了其背后的進化歷史，“我們提出了完整的進化假說，并用大量的證據(jù)加以支持” 。

“多年來，我們一直收集并分析幽門螺桿菌的數(shù)據(jù)，建立起很好的科研聲譽。”回憶起過去，丹尼爾的語氣中透著一絲自豪。

2022年10月，團隊發(fā)現(xiàn)了hardy菌株，大家無不為此感到振奮。經(jīng)過數(shù)月的研究，他們撰寫了論文，并將其公布在預印本平臺bioRXiv上。如今，論文已在Nature上順利發(fā)表。

談及在中國的科研體驗，丹尼爾總結(jié)為3個字——“很高效”。來到中國以后，在中國科學院的支持下，他迅速組建起一支強大的團隊。

事實上，在來中國之前，丹尼爾就已經(jīng)與中國的科研人員有合作，這為他日后組建團隊打下了良好的基礎。如今，他的研究團隊呈現(xiàn)出兩個顯著的特點：“金字塔”結(jié)構(gòu)和國際化。

“我們的團隊像一座金字塔。”丹尼爾解釋道，除了他本人外，團隊還有兩個“中堅力量”——青年研究員薩拉·斯文森（Sarah Svensson）和楊超。他們經(jīng)驗豐富，能夠獨立帶領項目，這大大提高了整體效率。其他成員也可以隨時和他們討論。

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（從左至右）丹尼爾、薩拉、楊超。

國際化同樣是團隊的一大優(yōu)勢。丹尼爾認為，國際化不僅提升了每個人的英語水平，還有助于大家學習不同的科研風格和思維方式。

“找到內(nèi)心的自由”

丹尼爾對科研的態(tài)度直率而篤定。雖然他已經(jīng)在Science和Nature這樣的頂刊上發(fā)表了6篇論文，但他不認為頂刊能代表頂尖的研究。他相信，好的科研不一定要在知名期刊上發(fā)表，而是要有實質(zhì)性的貢獻。對生物學領域來說，特別關鍵的是數(shù)據(jù)分析方法上的創(chuàng)新。

丹尼爾告訴《中國科學報》，有許多外國教授癡迷于“卷”論文數(shù)量，但他更在意科研的質(zhì)量。“不會執(zhí)著于許多項目，或多多益善地發(fā)表論文。我更看重一個好點子、一篇好論文的價值。”丹尼爾微笑著說。

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丹尼爾。

除了科研，丹尼爾還很快融入了上海的生活。他成為廣場舞圈中的“靈魂舞者”，跳起舞來恣意瀟灑，不拘一格。他會拍下自己與中國阿姨們共舞的動圖，做成表情包，每當所里有其他研究人員發(fā)了論文，就將表情包發(fā)在群里，以表慶祝。

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丹尼爾跳舞動圖。

“Find inner freedom（找到內(nèi)心的自由）”，這是丹尼爾的座右銘，也貫穿了他的人生選擇和科研追求。

“我在英國遇到了各種職業(yè)上的挫折，但在中國，我找到了新的機會。”丹尼爾說。每年夏天他會回到英國陪伴家人，但大部分時間還是沉浸在上海的工作和生活中。

在快節(jié)奏的生活中，丹尼爾努力保持內(nèi)心的自由。工作累了，他會暫時放下，“給自己放個假”，睡個懶覺。但即便是在休息時，他的思緒也從未停止。在走路甚至跳舞時，他常常思考不同的科研問題。

丹尼爾對中國充滿了熱情和好奇，是個“中國通”。他去過中國的6個省份遠足，攀登過一座5000米的高峰。“我喜歡中國的鄉(xiāng)村，尤其是西部，那里的人們以更傳統(tǒng)的方式生活，卻更加輕松和奔放。”丹尼爾說。

對于學生，丹尼爾并不強求他們?yōu)榭蒲型度脒^多的時間，他希望學生的動力來自內(nèi)心。“他們需要做足夠的工作才能畢業(yè)，但更重要的是，要從中找到自己的興趣點。”在丹尼爾看來，科研的迷人之處在于長期的、逐步深入的探索。

“當你投入得足夠深，事情就會開始變得有趣。”他說，幽門螺桿菌的研究正是如此——每一個細節(jié)、每一次發(fā)現(xiàn)都帶來新的驚喜。

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團隊就像大家庭。

在中國的這些年，他發(fā)現(xiàn)中國學生做事高效認真，但不太擅長找到自己的科研方向；而西方學生常常有自己的想法，但可能并不是好的想法。丹尼爾期待，下一代年輕人能夠平衡好中西方學生的優(yōu)缺點。

丹尼爾給學生的建議是：發(fā)展自己的興趣，尤其是參加更多體育鍛煉。“我認識很多優(yōu)秀的科學家，都有健康的體魄。”有時，丹尼爾會拉著自己的學生去跳舞。

對于中國社會一些不好的現(xiàn)象，丹尼爾也大膽開麥：“比較文化在中國相當普遍，我不喜歡它。它經(jīng)常讓人感到困惑——真正的目標是什么？”

在采訪的最后，丹尼爾分享了一則軼事：亞歷山大·格羅滕迪克被譽為“20世紀最偉大的數(shù)學家”，他的童年在躲避納粹迫害中度過。他沒有接受過正統(tǒng)的學校教育，而是生活在森林里，與大自然和動物為伴。

丹尼爾對此深有感觸。雖然他的經(jīng)歷與格羅滕迪克不同，但他也在跨越重洋的科研旅途中找到了自己的“內(nèi)心自由”。正是在不斷打破外在限制的過程中，真正的創(chuàng)新和突破得以產(chǎn)生。

論文鏈接：

https://doi.org/10.1038/s41586-024-07991-z

*文中圖片均為受訪者提供